硬式野球は大学野球が中心となって牽引されていましたが、軟式野球は少年野球の延長であり、まったく異なる発展を遂げていました。しかし、ついに大学にまでその熱が広がり、昭和6年（1931年）、東京時事新報社の主催で、第一回東京六大学軟式野球大会が開催されました。六大学の枠組みは現在と変わらず、明治大学・法政大学・立教大学・早稲田大学・慶応大学・東京大学の六校です。第一回大会の優勝は明治大学、準優勝は慶応大学でした。

　しかし、この時はあくまでも大会の開催であり、組織化はされていませんでした。東京六大学軟式野球連盟が結成されたのは、それから30年後の昭和36年（1961年）になってからです。ちなみに、硬式の東京六大学野球連盟は大正14年（1925年）創設でした。

軟式野球と硬式野球は世代別野球団体結成の順序が正反対で、それぞれおおよそ次のような順序になります。

【硬式野球】大学　→　青年（プロ）　→　少年

【軟式野球】少年　→　青年（一般）　→　大学

　東京六大学軟式野球連盟より先に、昭和24年に全日本大学軟式野球連盟が結成されますが、詳細については後ほど触れます。